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    上海miRNA測序實驗

    產品介紹

    上海miRNA測序實驗

    miRNA 測序是研究特定組織在特定狀態下的已知miRNA,分析預測新的miRNA,并對已知 miRNA 和新miRNA進行靶基因預測。通過對miRNA靶基因注釋及代謝通路分析,將鑒定出的 miRNA與相應表型差異關聯起來,為研究miRNA對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力的工具。

    上海miRNA測序實驗生物信息分析內容

    1、數據產出統計和質量評估

    2、sRNA在參考基因組上的分布

    3、sRNA分類注釋統計

    4、堿基偏好性分析

    5、基因表達水平分析

    6、新轉錄本預測

    7、差異miRNA靶基因預測

    8、差異基因篩選及聚類分析

    9、差異表達miRNA靶基因GO富集分析

    10、差異表達miRNA靶基因Pathway富集分析

    11、差異表達miRNA靶基因蛋白互作網絡分析

     

    技術參數

    樣本類型:total RNA

    樣本要求:總量≥3 μg,濃度≥200 ng/μL

    文庫類型:Small RNA文庫

    測序策略:HiSeq SE50,推薦數據量:≥10M reads

    項目周期:35個工作日

     

    結果示例

    樣本已知miRNA各位置堿基偏好性

     

    新miRNA二級結構及reads mapping示意圖

     

    各個樣本之間共有novel miRNA分布

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